Контроль за нелегальными мигрантами — это правильно.
Поскольку речь идет о нелегалах, то есть, как указано, иностранных гражданах, которые находились в РФ без законных оснований и не выехали из страны, либо не узаконили свое пребывание в России, то, по всей видимости, в реестр они будут попадать тогда, когда где-то себя проявят или попадут под проверку документов.
То есть реестр контролируемых лиц = реестр нелегальных мигрантов. Впрочем, если всех нелегальных мигрантов сразу депортировать, то и контролировать никого не надо. С моей точки зрения, этот вариант действий предпочтительнее.
